Program Sarjana Mikrobiologi di FIKES UMAHA  menyediakan pendidikan komprehensif yang difokuskan pada tiga aspek utama, yaitu pengetahuan dasar mengenai sel mikroba dan bioproses, pengembangan keterampilan ilmiah, dan penerapan mikroorganisme untuk mengatasi masalah sosial serta meningkatkan kualitas hidup.

Program Studi Mikrobiologi merupakan program empat tahun yang dimulai dengan penguatan ilmu dasar dan secara bertahap memperkenalkan mahasiswa pada berbagai bidang yang terkait dengan mikrobiologi. Melalui mata kuliah praktikum, kunjungan lapangan, kunjungan industri, dan magang, mahasiswa memperoleh pengetahuan dan keterampilan mendalam di berbagai bidang seperti industri pangan, kesehatan, dan lingkungan. Latihan keterampilan ilmiah dan sosial diintegrasikan dalam seluruh program. Pada tahun terakhir, mahasiswa akan melakukan proyek penelitian individu, mempresentasikan temuan mereka dalam sebuah kolokium, menyerahkan laporan tertulis, dan menyelesaikan ujian komprehensif.